公认的观点认为，只有古菌能产生甲烷，为什么总有一大批人分不清细菌和古菌

是同一个，产甲烷菌因为有一种辅酶易被氧化而失去活性，所以严格厌氧

B

三域系统是由carl
woese在1990年提出的生物分类，将原核生物分成了两大类，起初称为真细菌(eubacteria)和古细菌(archaebacteria).woese依据16s
rrna序列上的差别，认为这两组生物和真核生物从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别进化而来，因此将三者各划为一类，作为比界高的分类系统,称作"域"(domain)或者"总界"(superkingdom).目前这三域分别命名为细菌域(bacteria)、古菌域(archaea)和真核域(eukarya).
分子生物学的资料表明:产甲烷细菌、极端嗜盐细菌、极端耐酸耐热的硫化叶菌和嗜热菌质体等的16s
rrna核苷酸序列,既不同于一般细菌,也不同于真核生物.此外,这些生物的细胞膜结构、细胞壁结构、辅酶、代谢途径、trna和rrna的翻译机制均与一般细菌不同.因而有人主张将上述的生物划归原核生物和真核生物之外的"第三生物界"或古细菌界.
古细菌(archaeobacteria)
(又可叫做古生菌或者古菌)是一类很特殊的细菌,多生活在极端的生态环境中.具有原核生物的某些特征,如无核膜及内膜系统;也有真核生物的特征,如以甲硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、rna聚合酶和真核细胞的相似、dna具有内含子并结合组蛋白;此外还具有既不同于原核细胞也不同于真核细胞的特征,如:细胞膜中的脂类是不可皂化的;细胞壁不含肽聚糖,有的以蛋白质为主,有的含杂多糖,有的类似于肽聚糖,但都不含胞壁酸、d型氨基酸和二氨基庚二酸.
在细胞结构和代谢上,古菌在很多方面接近其它原核生物.然而在基因转录这两个分子生物学的中心过程上,它们并不明显表现出细菌的特徵,反而非常接近真核生物.

古菌是最古老的生命体，古菌一些奇特的生活习性和与此相关的潜在生物技术开发前景，长期以来一直吸引着许多人的注意。古菌常被发现生活于各种极端自然环境下，如大洋底部的高压热溢口、热泉、盐碱湖等。

壤分子微生态学研究古菌，一方面可以了解古菌在土壤早期形成所起的生化作用，更重要的是可以提高分子微生态学的水平，研究开发适用于当前生产、治污等方面的生物技术。

目前，古菌研究正在世界范围内升温，这不仅因为古菌中蕴藏着远多于另两类生物的、未知的生物学过程和功能，以及有助于阐明生物进化规律的线索，而且因为古菌有着不可估量的生物技术开发前景。古菌已经一次又一次让人们吃惊，可以肯定，在未来的岁月中，这群独特的生物将继续向人们展示生命的无穷奥秘。

古细菌是最古老的生命形式，古一些特殊的生活习惯和相关的潜在生物技术的发展前景，吸引了许多人的关注。古往往是生活在极端的自然环境，如海洋高压热溢流口，温泉，盐湖底部。

微生态古土壤分子，一方面，可以了解早期形成的古土壤中的生化扮演的角色，更重要的是，可以提高水平的分子微生态学，研究开发适用于目前生产，污染控制，生物技术等方面。

古是全球气候变暖，不仅是因为古承担远远超过其他两种类型的生物，未知的生物过程和功能，并有助于阐明生物的进化规律的线索，和古细菌的生物技术的发展前景无法估量的。古有一次又一次地让人们感到惊讶，可以肯定，在未来几年内，将继续展示这组独特的生物生活的无穷奥秘。

古细菌是最古老的生命形式，古一些特殊的生活习惯和相关的潜在生物技术的发展前景，吸引了许多人的关注。古往往是生活在极端的自然环境，如海洋高压热溢流口，温泉，盐湖底部。

微生态古土壤分子，一方面，可以了解早期形成的古土壤中的生化扮演的角色，更重要的是，可以提高水平的分子微生态学，研究开发适用于目前生产，污染控制，生物技术等方面。

古是全球气候变暖，不仅是因为古承担远远超过其他两种类型的生物，未知的生物过程和功能，并有助于阐明生物的进化规律的线索，和古细菌的生物技术的发展前景无法估量的。古有一次又一次地让人们感到惊讶，可以肯定，在未来几年内，将继续展示这组独特的生物生活的无穷奥秘。

古细菌是最古老的生命形式，古一些特殊的生活习惯和相关的潜在生物技术的发展前景，吸引了许多人的关注。古往往是生活在极端的自然环境，如海洋高压热溢流口，温泉，盐湖底部。

微生态古土壤分子，一方面，可以了解早期形成的古土壤中的生化扮演的角色，更重要的是，可以提高水平的分子微生态学，研究开发适用于目前生产，污染控制，生物技术等方面。

古是全球气候变暖，不仅是因为古承担远远超过其他两种类型的生物，未知的生物过程和功能，并有助于阐明生物的进化规律的线索，和古细菌的生物技术的发展前景无法估量的。古有一次又一次地让人们感到惊讶，可以肯定，在未来几年内，将继续展示这组独特的生物生活的无穷奥秘。

如同我们学习历史一样，是为了更好地了解、认清事物发展的内在规律，更好地应对当前和未来的挑战！

自然科学的专业研究亦是如此，首先说古菌的研究具有重要意义。古细菌包括3类不同的细菌：产甲烷细菌、极端嗜盐细菌和嗜酸嗜热细菌。它们生存在极端特殊的生态环境中，具有独特的16S核糖体RNA寡核苷酸谱。而且，它们在分子水平上与真核生物和真细菌都有不同之处或只与其中之一相同。例如，极端嗜盐细菌能行光合作用，但其光合作用色素并非叶绿素类的分子，而是与动物视网膜上的视紫红质相似的视紫红质。
原来以为有细胞形态的生物只有原核细胞和真核细胞两大类。自从发现古细菌以后，才将生物分为上述3大类，这就为探索生命起源和真核细胞起源提供了新的线索。
极端嗜热菌（themophiles）：能生长在90℃以上的高温环境。如斯坦福大学科学家发现的古细菌，最适生长温度为100℃，80℃以下即失活，德国的斯梯特（K. Stetter）研究组在意大利海底发现的一族古细菌，能生活在110℃以上高温中，最适生长温度为98℃，降至84℃即停止生长；美国的J. A. Baross发现一些从火山口中分离出的细菌可以生活在250℃的环境中。嗜热菌的营养范围很广，多为异养菌，其中许多能将硫氧化以取得能量。
极端嗜盐菌（extremehalophiles）：生活在高盐度环境中，盐度可达25%，如死海和盐湖中。
极端嗜酸菌（acidophiles）：能生活在pH值1以下的环境中，往往也是嗜高温菌，生活在火山地区的酸性热水中，能氧化硫，硫酸作为代谢产物排出体外。
极端嗜碱菌（alkaliphiles）：多数生活在盐碱湖或碱湖、碱池中，生活环境pH值可达11.5以上，最适pH值8～10。
产甲烷菌（metnanogens）：是严格厌氧的生物，能利用CO2使H2氧化，生成甲烷，同时释放能量。
CO2＋4H2→CH4＋2H2O＋能量
由于古细菌所栖息的环境和地球发生的早期有相似之处，如：高温、缺氧，而且由于古细菌在结构和代谢上的特殊性，它们可能代表最古老的细菌。它们保持了古老的形态，很早就和其它细菌分手了。所以人们提出将古细菌从原核生物中分出，成为与原核生物（即真细菌eubacteria）、真核生物并列的一类。

土壤分子微生态学研究古菌，一方面可以了解古菌在土壤早期形成所起的生化作用，更重要的是可以提高分子微生态学的水平，研究开发适用于当前生产、治污等方面的生物技术。
补充回答：
举例来说，古菌一些奇特的生活习性和与此相关的潜在生物技术具有重要意义和开发前景。

古菌常被发现生活于各种极端自然环境下，如大洋底部的高压热溢口、热泉、盐碱湖等。事实上，在我们这个星球上，古菌代表着生命的极限，确定了生物圈的范围。

产甲烷古菌能够利用简单基质产甲烷。它们处于厌氧发酵过程中最后一个环节，在自然界碳素循环中扮演重要角色。研究产甲烷古菌，对生物质能的利用有重要的应用价值。产甲烷菌能利用CO2使H2氧化，生成甲烷，同时释放能量。产甲烷古菌可将无机或有机化合物厌氧转化成甲烷和二氧化碳，在沼气发酵、有机废弃物处理和全球大气中的甲烷释放等过程中起着重要作用。目前已有19种产甲烷古菌的基因组完成了测序,其基因组学和蛋白质组学研究以及未培养产甲烷古菌的多样性研究正蓬勃开展。已知的甲烷生物合成途径分别以乙酸、氢/二氧化碳、甲基化合物为底物,通过不同途径,最后在甲基辅酶M还原酶的催化下释放出甲烷。产甲烷古菌的资源多样性和组学水平的代谢调控机制研究将为持续开发可再生能源、开展环境监测和治理提供坚实的理论基础。
继续追问：
实验主要是研究下施肥状况对细菌种群的影响，应该涉及到氮循环（氨氧化细菌等）、硫循环（硫细菌），古菌的话不是很理解，在土壤中古菌会在土层20-40处吗？还是更为厌氧的环境条件
补充回答：
不一定，近年来，利用分子生物学方法发现，古菌广泛分布于各种自然环境中，土壤、海水、沼泽地中均生活着古菌。实验室也可培养（主要包括三大类：产甲烷菌、极端嗜热菌和极端嗜盐菌）。其中自然界中，产甲烷菌生活于富含有机质且严格无氧的环境中，如沼泽地、水稻田、反刍动物的反刍胃等；极端嗜盐菌生活于盐湖、盐田及盐腌制品表面，它能够在盐饱和环境中生长；极端嗜热菌通常分布于含硫或硫化物的陆相或水相地质热点，如含硫的热泉、泥潭、海底热溢口等。